本片是杜琪峰的實驗之作，丫丫姐妹们的神圣秘密最大特色在於採用醫護人員嫁接警匪片，在極封閉的醫院空間內塑造了一種緊張，懸疑的氣氛，許多不合理的偶然細節推動情節的高速發展，彷彿是隱藏在緊張情節下的暗湧張力。醫生，警察，悍匪的三方如同難以解開的繩子，彼此牽引著對方的要害，丫丫姐妹们的神圣秘密就像一顆即將引爆的炸彈一樣，迎來了最後槍戰戲的高潮，可見杜琪峰對警匪片的節奏掌握還是相當純熟。當然，也少不了杜琪峰招牌式的政治隱喻，警察和醫生的衝突如同香港和大陸新移民的矛盾，一直裝瘋賣傻的老人得以在槍戰以及病痛中全身而退，頭部中彈的高智商罪犯充滿自信心玩弄一切事物，卻躲不過手术失败令人擺佈的結局，這一點既是無奈，丫丫姐妹们的神圣秘密也是看透現實給香港人的重要啟示。